Linux 应用基础：文件、目录与常用命令

Linux 命令行的核心并不是记忆大量命令，而是理解三件事：我在哪里、我要操作什么、结果要去哪里。

认识当前目录

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pwd
ls
ls -lah

pwd 显示当前路径；ls 列出目录内容；-l 显示详细信息，-a 包含隐藏文件，-h 将文件大小显示为更容易阅读的单位。

路径分为两类：

  • 绝对路径从根目录 / 开始；
  • 相对路径从当前目录开始，. 表示当前目录，.. 表示上一级目录。

创建、复制和移动

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mkdir practice
touch practice/notes.txt
cp practice/notes.txt practice/notes-copy.txt
mv practice/notes-copy.txt practice/archive.txt

处理文件前可以先用 ls 检查目标位置。批量移动或删除时尤其要谨慎，不要在没有确认路径的情况下使用通配符。

查看文本文件

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head -n 5 example.txt
tail -n 5 example.txt
less example.txt
wc -l example.txt

head 和 tail 适合快速查看开头与结尾；less 可以分页浏览大文件；wc -l 统计行数。

对很大的生物信息学文本文件，不要直接用编辑器完整打开。先查看文件大小，再用 head、tail 或流式命令抽样。

搜索文本和文件

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grep -n "keyword" notes.txt
find . -type f -name "*.txt"

grep 在文本中找内容，find 在目录树中找文件。可以先限制搜索目录和文件类型，减少不必要的扫描。

理解权限

ls -l 输出最左侧类似 -rw-r--r-- 的字段表示权限。三组字符分别对应文件所有者、所属组和其他用户。

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chmod u+x run.sh

这条命令为文件所有者增加执行权限。不要习惯性使用过宽的权限；只开放完成任务所需的最小范围。

先检查，再执行

一个安全的小习惯是：先打印目标，再执行改变文件的命令。命令行效率很高，但也意味着错误操作会被迅速放大。

学会路径、输入输出和权限之后，新的 Linux 命令通常只是这套模型上的不同工具。

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Linux Coreutils 文档

官方命令参考；不是本文的配套代码

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